Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF839A8K0R7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF839A8K0R7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF839A8K0R7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF839A8K0R7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms