Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MAP1LC3B2A6NCE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MAP1LC3B2A6NCE7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms