Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A3GALT2U3KPV4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms