Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCOA3Q9Y6Q9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms