Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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