Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC2Q9Y2U9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms