Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX7Q9UNH6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms