Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED23Q9ULK4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms