Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms