Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms