Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms