Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNIKQ9UKE5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms