Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSR3Q9UJK0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSR3Q9UJK0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms