Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATPIF1Q9UII2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms