Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms