Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms