Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA6Q9UF33 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms