Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFIP11Q9UBB9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFIP11Q9UBB9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms