Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPF2Q9P2E5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms