Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms