Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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