Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDL2Q9NX52 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms