Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms