Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms