Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ASF1BQ9NVP2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms