Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDP1Q9NUW8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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