Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms