Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPHNQ9NQX3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms