Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA4BQ9NPR2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms