Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRRC4Q9HBW1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRRC4Q9HBW1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms