Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ELL3Q9HB65 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms