Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLMPQ9H6B4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms