Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 SDR16C6P-202ENST00000524136 955 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RN7SL819P-201ENST00000581896 270 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms