Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT23Q9C075 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT23Q9C075 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT23Q9C075 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT23Q9C075 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms