Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM3Q9BZL3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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