Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms