Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSD3Q9BZ95 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms