Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPERQ9BY12 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPERQ9BY12 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms