Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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