Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KATNB1Q9BVA0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms