Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRG3Q99928 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRG3Q99928 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms