Protein–RNA interactions for Protein: Q96RM1

SPRR2F, Small proline-rich protein 2F, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR2FQ96RM1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SPRR2FQ96RM1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms