Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms