Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms