Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPR78Q96P69 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms