Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD27Q96NW4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms