Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms