Protein–RNA interactions for Protein: Q96J86

CYYR1, Cysteine and tyrosine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYYR1Q96J86 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYYR1Q96J86 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms