Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TPD52L3Q96J77 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms