Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHDQ96IW2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHDQ96IW2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms